PERBANDINGAN HASIL METODE IDENTIFIKASI SPESIES : MORFOLOGI DAN MOLEKULER PADA IKAN JULUNG-JULUNG DI TPI (TEMPAT PELELANGAN IKAN) MUARA ANGKE, DKI JAKARTA
Abstract
ABSTRACT
The Congaturi halfbeak (Hyporhampus limbatus), also known as the Valenciennes halfbeak, is an important economic fish in the fisheries sector of Indonesia, with a high level of diversity. The high diversity creates difficulties in the identification process for each species. The identification of species can be based on morphological and molecular methods. Therefore, this study aimed to compare the results of the morphological and molecular identification methods using a sample of H. limbatus. Morphological identification was carried out using morphometric techniques and for molecular identification following DNA Barcoding protocol. The results showed both morphological and molecular methods indicate that the sample was identified as Hyporhampus limbatus. The morphology of the Hyporhampus limbatus has an elongated body shape with a silvery color filled with scales all over his body except on the head. The lower jaw is taper in shape longer than the upper jaw and has an immarginate tail. While for the DNA Barcoding results show high similiraty (97%) and percentage of query coverage (98%) to identify Hyporhampus limbatus.
Keyword: morphological, molecular, garfish
ABSTRAK
Ikan julung-julung (Hyporhampus limbatus) merupakan ikan ekonomis penting di sektor perikanan Indonesia yang memiliki tingkat keragaman yang tinggi. Tingginya keragaman menyebabkan kesulitan dalam proses identifikasi dari setiap spesies. Metode yang dapat digunakan untuk identifikasi spesies adalah metode morfologi dan molekuler. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan hasil dari metode identifikasi morfologi dan molekuler dengan menggunakan sampel ikan julung-julung. Identifikasi morfologi dilakukan menggunakan teknik morfometrik sedangkan untuk molekuler diaplikasikan dengan DNA Barcoding. Hasil identifikasi dengan metode morfologi dan molekuler menunjukkan hasil yang sama yaitu Hyporhampus limbatus. Berdasarkan hasil identifikasi morfologi Hyporhampus limbatus memiliki bentuk tubuh yang memanjang dengan warna perak dengan sisik di seluruh tubuhnya kecuali pada bagian kepala. Rahang bawahnya berbentuk lancip dengan ukuran lebih panjang dibandingkan dengan rahang atas serta memiliki ekor imarginate. Hasil molekuler (DNA Barcoding) menunjukkan bahwa Hyporhampus limbatus memiliki nilai yang tinggi untuk tingkat kemiripan (97%) dan Query Cover (98%).
Kata kunci: morfologi, molekuler, ikan julung-julung
Full Text:
PDF (Bahasa Indonesia)References
Achmad, M,J., Djamhur, M., Fabanyo, M.A., Akbar, N. (2019). Aplikasi DNA Barcoding Ikan Julung-julung (Hemirhampus sp.) di Perairan Laut Maluku Utara. Jurnal Iktilogi Indonesia, 19(3), 463-473
Anzani, L., Madduppa, H., Nurjaya, I.W., Dias, P. J. (2019). Short Communication: Moleculer Identificationof White Sea Squirt Didemnum sp. (Tunicata, Ascidiacea) Colonies Growing Over Corals in Raja Ampat Island, Indonesia. Jurnal Biodiversitas, 20(3), 636-642
Bafagih, A., Hamzah, S., Tangke, U. (2018). Sebaran Konsentrasi Klorofil-a Hubungannya dengan Hasil Tangkapan Ikan Julung di Perairan Ternate. Jurnal Akuakultur, Pesisir dan Pulau-Pulau Kecil, 2(1), 1-4
Bingpeng, X., Heshan, L., Zhilan, Z., Chunguang, W., Yanguo, W., Jianjun, W. (2018). DNA Barcoding for Identification of Fish Species in the Taiwan Srait. Third Institute of Oceanography State Oceanic Administration, Xiamen, Fujian, China
Collette, B. B. (1974). The garfishes (Hemiramphidae) of Australia and New Zealand. Rec Aust Mus, 29, 11-105.
Collette, B. B., & Su, J. (1986). The halfbeaks (Pisces, Beloniformes, Hemiramphidae) of the Far East. Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia, 138(1), 250-302.
Collette, B.B. (1978). Hemiramphidae. In W. Fischer (ed.) FAO species identification sheets for fishery purposes. Western Central Atlantic (Fishing Area 31), Volume 2. FAO, Rome
Fadhil, R., Muchlisin, Z. A., & Sari, W. (2016). Hubungan panjang-berat dan morfometrik ikan julungjulung (Zenarchopterus dispar) dari perairan pantai utara Aceh. Jurnal Ilmiah Mahasiswa Kelautan Perikanan Unsyiah, 1(1), 146-159
Genisa, A. S. (1999). Pengenalan jenis-jenis ikan laut ekonomi penting di Indonesia. Jurnal Oseana, 24(1), 17-38.
Hebert, P. D., Ratnasingham, S., & De Waard, J. R. (2003). Barcoding animal life: cytochrome c oxidase subunit 1 divergences among closely related species. Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences, 270(suppl_1), S96-S99.
Hidayat, T. and Pancoro, A. (2008). Kajian Filogenetik Molekuler dan Peranannya dalam Menyediakan Informasi Dasar untuk Meningkatkan Kualitas Sumber Genetik Anggrek. Jurnal Agro Biogen, 4 (1), 35- 40.
Irawan, P. D., Tallei, T. E., & Kolondam, B. J. (2016). Analisis sekuens dan filogenetik beberapa tumbuhan Syzygium (Myrtaceae) di Sulawesi Utara berdasarkan gen matK. Jurnal Ilmiah Sains, 16(2), 43-50.
KKBI Online. (2019). Diakses pada tanggal 30 Desember 2019 pukul 07.00 WIB. www.kbbionline.com
Kusumah,R V., Kusrini, E., Fahmi, M R. (2016). Biologi, Potensi, Dan Upaya Budi Daya Julung-Julung Zenarchopteridae Sebagai Ikan Hias Asli Indonesia. Prosiding Seminar Nasional Ikan ke 8, 303
Madduppa, H., Ayuningtyas, R.U., Subhan, B., Arafat, D., Prehadi. (2016). Exploted but Unevaluated: DNA Barcoding Reveals Skate and Stingrays (Chordata, Chondrichthyes) Spescies Landed in The Indonesian Fish Market. Jurnal Ilmu Kelautan, 21(2), 77-84
Madduppa, H., Subhan, B., Anggraini, N. P., Fadillah, R., & Tarman, K. (2017). DNA barcoding reveals vulnerable and not evaluated species of sea cucumbers (Holothuroidea and Stichopodidae) from Kepulauan Seribu reefs, Indonesia. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 18(3), 893-898.
Muttaqin, Z., Dewiyanti, I., Aliza, D. (2016). Kajian Hubungan Berat dan Faktor Kondisi Ikan Nila (Oreochromis niloticus) dan Ikan Belanak (Mugil cephalus) yang Tertangkap DI Sungai Matang Guru, Kecamatan Madat, Kabupaten Aceh Timur. Jurnal Ilmiah Mahasiswa Kelautan dan Perikanan Unsyiah, 1(3), 397-403
Myers, P., R, Espinosa. (2013). http://animaldiversity.ummz.umich.Edu/collections/contributors/Grzimek_fish/Clupeiformes/Chirocentrus_dorab/. Diakses: 06 Desember 2019
Nadia, R. N. (2016). Buruh Angkut dan Keluarga Nelayan di Pelabuhan Muara Angke. Lembaran Sejarah, 12(1), 44-58.
Prehadi, P., Sembiring, A., Kurniasih, E. M., Rahmad, R., Arafat, D., Subhan, B., & Madduppa, H. H. (2015). DNA barcoding and phylogenetic reconstruction of shark species landed in Muncar fisheries landing site in comparison with Southern Java fishing port. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 16(1).
Rohimah, S., Mukarramah, L., Sindiya, V., Veren Yuliana, S., Gita Ayu, K., & Su’udi, M. (2018). Eksplorasi Jenis dan Potensi DNA Barcode Anggrek Thrixspermum Secara In Silico. Jurnal Biodjati, 3(2), 148-156.
Sembiring, A., Pertiwi, N. P. D., Mahardini, A., Wulandari, R., Kurniasih, E. M., Kuncoro, A. W., & Carpenter, K. E. (2015). DNA barcoding reveals targeted fisheries for endangered sharks in Indonesia. Fisheries Research, 164, 130-134.
Suryawan, I G., Mahrus, K. (2016). Studi Karakteristik Morfometrik Ikan Julung-Julung (Hemiramphus Archipelagicus) Di Daerah Intertidal Teluk Ekas. Jurnal Biologi Tropis, 16(2), 37-42
Triandiza, T., Madduppa H. (2018). Aplikasi Analisa Morfologi Dan Dna Barcoding Pada Penentuan Jenis Kepiting Porcelain (Pisidia Sp.) Yang Berasal Dari Pulau Tunda, Banten. Jurnal Sumberdaya Akuatik Indopasifik, 2(2)
Utami, R. T., Zamani, N. P., & Madduppa, H. H. (2018). Molecular identification,
abundance and distribution of the coral-killing sponge Terpios hoshinota in Bengkulu and Seribu Islands, Indonesia. Biodiversitas Journal of Biological Diversity, 19(6), 2238-2246.
Ward, R. D., Zemlak, T. S., Innes, B. H., Last, P. R., & Hebert, P. D. (2005). DNA barcoding Australia's fish species. Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 360(1462), 1847-1857.
Zuhdi, M. F., & Madduppa, H. (2020). Identifikasi Caesio cuning berdasarkan Karakterisasi Morfometrik dan DNA Barcoding yang didaratkan di Pasar Ikan Muara Baru, Jakarta. Jurnal Kelautan Tropis, 23(2), 199-206.
DOI: https://doi.org/10.21107/jk.v13i3.7303
Refbacks
- There are currently no refbacks.
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Jurnal Kelautan by Program Studi Ilmu Kelautan is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Published by: Department of Marine Sciences, Trunojoyo University of Madura